期刊简介
本刊由上海第二医科大学主办，上海第二医科大学附属仁济医院、上海市消化疾病研究所编辑出版。本刊作为消化专业综合性学术刊物，将及时传递国内外最新学术信息，登载优秀的研究论著、文献综述和述评，对不同学术观点兼收并蓄，突出科学性和严肃性，为消化学病领域内研究成果和信息的交流与沟通提供园地。此外，本刊还开设专家论坛、特约/国外来稿、短篇论著、临床交流、诊疗技术、讲座、会议纪要、共识意见、学术争鸣、病例分析与个案报道等栏目。
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首页>胃肠病学杂志
- 杂志名称：胃肠病学杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：上海交通大学医学院附属仁济医院
- 国际刊号：1008-7125
- 国内刊号：31-1797/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 文摘与引文数据库, 医学文摘, 万方收录(中)
结直肠癌相关差异表达基因的生物信息学分析
王婷；许冰；张静；郑莹；董蕾
关键词：结直肠肿瘤, 生物信息学, 微阵列分析, 差异表达基因
摘要：背景:结直肠癌(CRC)是消化系统常见肿瘤,发病率和死亡率较高.目的:应用生物信息学方法对CRC差异表达基因进行分析,筛选与CRC发生、发展相关的基因.方法:从公共基因表达数据库(GEO)下载CRC基因芯片GSE32323、GSE21510、GSE9348数据集,使用R语言筛选差异表达基因.在DAVID数据库中对差异表达基因行GO和KEGG分析.应用STRING、Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出CRC的核心基因.结果:在三个数据集中共筛选出834个CRC共同差异表达基因,包括376个上调基因和456个下调基因.GO分析表明差异表达基因主要参与细胞分裂、增殖、代谢等过程.KEGG分析显示差异表达基因主要富集于p53通路和细胞外基质蛋白通路.PPI网络共筛选出20个核心基因.结论:运用生物信息学方法对CRC基因芯片进行分析可为CRC发病机制、肿瘤标记物的筛选和治疗药物靶点的选择提供理论基础.
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