期刊简介
本刊由上海第二医科大学主办，上海第二医科大学附属仁济医院、上海市消化疾病研究所编辑出版。本刊作为消化专业综合性学术刊物，将及时传递国内外最新学术信息，登载优秀的研究论著、文献综述和述评，对不同学术观点兼收并蓄，突出科学性和严肃性，为消化学病领域内研究成果和信息的交流与沟通提供园地。此外，本刊还开设专家论坛、特约/国外来稿、短篇论著、临床交流、诊疗技术、讲座、会议纪要、共识意见、学术争鸣、病例分析与个案报道等栏目。
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首页>胃肠病学杂志
- 杂志名称：胃肠病学杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：上海交通大学医学院附属仁济医院
- 国际刊号：1008-7125
- 国内刊号：31-1797/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 文摘与引文数据库, 医学文摘, 万方收录(中)
应用基因芯片技术筛选结直肠癌中差异DNA甲基化位点
余捷；王梓桦；杨世英；薛寒冰
关键词：DNA甲基化, 结直肠肿瘤, 芯片分析技术
摘要：背景:DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与结直肠癌等多种肿瘤的发生、发展密切相关,但具体作用机制尚未完全明确.筛选特异性甲基化基因和构建肿瘤的甲基化表达谱已成为当前研究热点.目的:应用基因甲基化芯片技术初步筛选结直肠癌组织与癌旁正常黏膜组织间差异甲基化位点,构建特异性结直肠癌差异甲基化基因谱.方法:应用甲基化450K芯片技术对6例结直肠癌及其癌旁组织进行甲基化分析,共分析位点431 467个,按P值筛选出异常甲基化位点,按甲基化β值差值区分高甲基化位点和低甲基化位点;对筛选出的差异甲基化位点进一步行GO分析和KEGG分析,了解差异甲基化位点的功能.结果:共检出结直肠癌和癌旁正常组织显著差异的甲基化位点3 649个,其中高甲基化位点1 259个,主要分布于基因启动子区和基因体,筛选出特异的SLC15A3等高甲基化基因;低甲基化位点共2 390个,主要分布于基因间区和基因体,筛选出特异的ACOT2、TTLL8、UHRF1等低甲基化基因.GO分析和KEGG分析发现,这些基因功能与DNA结合、转录因子活性、信号转导通路等有关.结论:结直肠癌和癌旁正常组织存在大量差异甲基化位点,提示DNA异常甲基化与结直肠癌的发生、发展密切相关.基因芯片技术可用于结直肠癌差异甲基化位点的初筛,但构建结直肠癌差异甲基化谱作为临床分子标记物仍需行进一步验证.
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